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3 Plugins gefunden
dsh-mol (dsh-ui)
yijian-quiet/dsh-mol
Chemie-Arbeitsfläche in der DSH-Weboberfläche. Strukturen auf einer Ketcher-Leinwand zeichnen; ein Skript lädt den Build herunter, der lokal im Browser ohne Backend gerendert wird. RDKit berechnet das aktuelle Molekül ohne Modellaufruf: Formel, Massen, logP, TPSA, H-Bindungsdonoren/-akzeptoren, Ringe, Fsp3, Stereozentren, Lipinski-/Veber-Prüfungen, QED, PAINS-/BRENK-Warnungen, Murcko-Gerüst sowie SMARTS-Suche, Ähnlichkeit, Formatumwandlung, Standardisierung und Stapelbereinigung. Der Retrosynthese-Reiter spricht über einen austauschbaren Backend-Prozess mit JSON-Ein-/Ausgabe (standardmäßig Retro*) und nennt fehlende Komponenten, statt einen Weg zu erfinden. Die Berechnung übernimmt das separat per pip zu installierende Pythonpaket des Repositorys (rdkit).
dsh-mol (dsh-bundle)
yijian-quiet/dsh-mol
Registriert den netzwerkfreien, auf RDKit basierenden stdio-MCP-Server dsh-mol in einem DSH-Profil. 12 Werkzeuge: dreistufige SMILES-Prüfung mit verständlichen Diagnosen und Zeichenpositionen, Moleküleigenschaften, Arzneimittelähnlichkeit und Strukturwarnungen, PNG/SVG-Darstellung, Molekülraster, Konvertierung von SMILES/InChI/InChIKey/MOL/SDF/Formel, Standardisierung mit Protokoll je Schritt, Deduplizierung, SMARTS-Teilstruktursuche, Fingerprint-Ähnlichkeit und Stapelbereinigung mit Meldung jeder abgelehnten Zeile. Der Patch registriert nur den Server; das Werkzeug-Pythonpaket muss zuerst installiert werden. Das README beschreibt `pip install` und Quellinstallation; bis zur Veröffentlichung auf PyPI funktioniert der Quellweg.
gaussian-dsh-plugin
yangdw2024/gaussian-dsh-plugin
DSH-Plugin für Gaussian 16: SMILES-zu-3D, Eingabegenerierung, sequenzielle Jobverwaltung, Ausgabeanalyse und Multiwfn/VMD-Nachbearbeitung (Orbital/ESP/RDG).