Plugins

Système de mémoire biomimétique pour DeepSeek Harness : un magasin SQLite unique (node:sqlite, WAL) dont l'arbre Markdown est conservé comme miroir en lecture seule ; outils de mémoire, injection d'instantané figé au démarrage de la session, validation par approbation graduée, extraction à la demande de la session en cours, fusion des quasi-doublons, cycle de vie d'archivage et de remplacement, métabolisme de la mémoire (dream), épingles de mémoire, rappel sémantique sur embeddings locaux, et la commande /memory.

Vérification de rapport complet pour les rapports scientifiques : contrôles par affirmation contre Crossref, PubMed (analyse des rétractations), ClinicalTrials.gov, UniProtKB, GEO/SRA et PatentsView, accessibilité des URL et concordance des titres, sens affirmation-vs-source à température 0, et un registre d'audit durable et redémarrable avec un rapport annoté.

Plugin bio-informatique « analyse à la demande » : couverture complète BioPython (exécuteur de code arbitraire bio_python + 14 skills de domaine) + outils sémantiques haute fréquence + environnement Python auto-amorcé zéro dépendance (uv + venv + biopython téléchargé automatiquement dans le répertoire privé du plugin). L'utilisateur télécharge et installe puis formule ses vœux.

蛋白质结构预测与设计插件：序列设计（ProteinMPNN/SolubleMPNN/LigandMPNN）、结构预测（ESMFold）、复合物界面筛选、序列理化打分与多样性聚类——零手动自举（本地 CPU/GPU 自适应），供 dsh-bio-genie 消费 | Protein structure prediction & design toolkit for dsh (sequence design, folding, interface screening)

基因组尺度代谢模型（GEM）构建插件：输入细菌全基因组（蛋白FASTA，支持多质粒/多染色体），自动构建+验证+补洞+出报告（SBML + 模型卡），供 dsh-bio-genie 消费工具加载使用 | Genome-scale metabolic model builder for dsh

Bioinformatics workflow catalog, WDL bundle store, and declarative preflight for DeepSeek Harness.