Plugin

Sistema di memoria biomimetica per DeepSeek Harness: un singolo archivio SQLite (node:sqlite, WAL) il cui albero Markdown è mantenuto come mirror di sola lettura; strumenti di memoria, iniezione di snapshot congelato all'avvio della sessione, gating di approvazione graduato, estrazione on-demand della sessione corrente, fusione dei quasi duplicati, un ciclo di vita di archiviazione e sostituzione, metabolismo della memoria (dream), pin di memoria, richiamo semantico su embedding locali, e il comando /memory.

Verifica dell'intero report per report scientifici: controlli per singola affermazione contro Crossref, PubMed (scansione delle ritrattazioni), ClinicalTrials.gov, UniProtKB, GEO/SRA e PatentsView, accessibilità degli URL e corrispondenza dei titoli, significato affermazione-vs-fonte a temperatura 0, e un registro di audit durevole e riavviabile con un report annotato.

Plugin di bioinformatica «analisi a desiderio»: copertura completa BioPython (esecutore di codice arbitrario bio_python + 14 skill di dominio) + strumenti semantici ad alta frequenza + ambiente Python autoavviante a zero dipendenze (uv + venv + biopython scaricato automaticamente nella directory privata del plugin). L'utente scarica e installa per l'analisi a desiderio.

蛋白质结构预测与设计插件：序列设计（ProteinMPNN/SolubleMPNN/LigandMPNN）、结构预测（ESMFold）、复合物界面筛选、序列理化打分与多样性聚类——零手动自举（本地 CPU/GPU 自适应），供 dsh-bio-genie 消费 | Protein structure prediction & design toolkit for dsh (sequence design, folding, interface screening)

基因组尺度代谢模型（GEM）构建插件：输入细菌全基因组（蛋白FASTA，支持多质粒/多染色体），自动构建+验证+补洞+出报告（SBML + 模型卡），供 dsh-bio-genie 消费工具加载使用 | Genome-scale metabolic model builder for dsh

Bioinformatics workflow catalog, WDL bundle store, and declarative preflight for DeepSeek Harness.