플러그인

DeepSeek Harness용 생체모방 메모리 시스템: Markdown 트리를 읽기 전용 미러로 유지하는 단일 SQLite 저장소(node:sqlite, WAL). 메모리 도구, 세션 시작 시 고정 스냅샷 주입, 등급별 승인 게이팅, 현재 세션의 온디맨드 추출, 거의 중복 병합, 아카이브 및 대체 수명 주기, 메모리 대사(dream), 메모리 핀, 로컬 임베딩을 통한 의미적 검색, 그리고 /memory 명령어.

과학 보고서 전체 검증: Crossref, PubMed(철회 스캔), ClinicalTrials.gov, UniProtKB, GEO/SRA 및 PatentsView에 대한 주장별 검사, URL 접근성과 제목 일치, temperature 0 에서의 주장과 출처 의미 비교, 그리고 주석이 달린 보고서를 갖춘 영구적이며 재개 가능한 감사 원장.

생물정보학 '소원식 분석' 플러그인: BioPython 완전 기능 커버(임의 코드 실행기 bio_python + 14개 도메인 skill) + 고빈도 의미 도구 + 제로 의존성 자체 부트 Python 환경(uv + venv + biopython을 플러그인 프라이빗 디렉터리에 자동 다운로드). 사용자가 다운로드하여 설치하는 즉시 소원식 분석 가능.

蛋白质结构预测与设计插件：序列设计（ProteinMPNN/SolubleMPNN/LigandMPNN）、结构预测（ESMFold）、复合物界面筛选、序列理化打分与多样性聚类——零手动自举（本地 CPU/GPU 自适应），供 dsh-bio-genie 消费 | Protein structure prediction & design toolkit for dsh (sequence design, folding, interface screening)

基因组尺度代谢模型（GEM）构建插件：输入细菌全基因组（蛋白FASTA，支持多质粒/多染色体），自动构建+验证+补洞+出报告（SBML + 模型卡），供 dsh-bio-genie 消费工具加载使用 | Genome-scale metabolic model builder for dsh

Bioinformatics workflow catalog, WDL bundle store, and declarative preflight for DeepSeek Harness.