Plugins

Sistema de memória biomimético para DeepSeek Harness: um único repositório SQLite (node:sqlite, WAL) cuja árvore Markdown é mantida como espelho somente leitura; ferramentas de memória, injeção de snapshot congelado no início da sessão, gateamento de aprovação graduada, extração sob demanda da sessão atual, fusão de quase duplicatas, um ciclo de vida de arquivo e substituição, metabolismo de memória (dream), pinos de memória, recuperação semântica sobre embeddings locais, e o comando /memory.

Verificação de relatório inteiro para relatórios científicos: verificações por afirmação contra Crossref, PubMed (varredura de retratações), ClinicalTrials.gov, UniProtKB, GEO/SRA e PatentsView, acessibilidade de URL e concordância de títulos, significado afirmação-versus-fonte em temperatura 0, e um livro-razão de auditoria durável e reiniciável com um relatório anotado.

Plugin de bioinformática «análise por desejo»: cobertura completa de BioPython (qualquer executor de código bio_python + 14 skills de domínio) + ferramentas semânticas de alta frequência + ambiente Python auto-bootstrap sem dependências (uv + venv + biopython baixado automaticamente para o diretório privado do plugin). Usuários baixam e instalam para análises por desejo.

蛋白质结构预测与设计插件：序列设计（ProteinMPNN/SolubleMPNN/LigandMPNN）、结构预测（ESMFold）、复合物界面筛选、序列理化打分与多样性聚类——零手动自举（本地 CPU/GPU 自适应），供 dsh-bio-genie 消费 | Protein structure prediction & design toolkit for dsh (sequence design, folding, interface screening)

基因组尺度代谢模型（GEM）构建插件：输入细菌全基因组（蛋白FASTA，支持多质粒/多染色体），自动构建+验证+补洞+出报告（SBML + 模型卡），供 dsh-bio-genie 消费工具加载使用 | Genome-scale metabolic model builder for dsh

Bioinformatics workflow catalog, WDL bundle store, and declarative preflight for DeepSeek Harness.