插件

为 DeepSeek Harness 打造的生物仿生记忆系统：以单一 SQLite 库为唯一事实来源（node:sqlite，WAL），Markdown 树仅作只读镜像；含 memory 工具、会话启动时的冻结快照注入、分级审批门、按需把当前会话抽取成记忆、近重复合并、归档与取代生命周期、记忆代谢（dream）、记忆钉、基于本地嵌入的语义检索，以及 /memory 命令。

面向科研报告的整篇校验工作流：逐条核对 Crossref、PubMed（含撤稿扫描）、ClinicalTrials.gov、UniProtKB、GEO/SRA 和 PatentsView，核验 URL 可访问性与标题一致性，以温度 0 判定声明与原文含义一致，输出可恢复的审计账本与标注版校验报告。

生物信息学「许愿式分析」插件：BioPython 全功能覆盖（任意代码执行器 + 14 个领域 skill）+ 高频语义化工具 + 零依赖自举 Python 环境，下载安装即可用。

蛋白质结构预测与设计插件：序列设计（ProteinMPNN/SolubleMPNN/LigandMPNN）、结构预测（ESMFold）、复合物界面筛选、序列理化打分与多样性聚类——零手动自举（本地 CPU/GPU 自适应），供 dsh-bio-genie 消费 | Protein structure prediction & design toolkit for dsh (sequence design, folding, interface screening)

基因组尺度代谢模型（GEM）构建插件：输入细菌全基因组（蛋白FASTA，支持多质粒/多染色体），自动构建+验证+补洞+出报告（SBML + 模型卡），供 dsh-bio-genie 消费工具加载使用 | Genome-scale metabolic model builder for dsh

面向 DeepSeek Harness 的生物信息学工作流目录、WDL 资产库与声明式预检。