Plugins

Sistema de memoria biomimético para DeepSeek Harness: un único almacén SQLite (node:sqlite, WAL) cuyo árbol Markdown se mantiene como espejo de solo lectura; herramientas de memoria, inyección de instantánea congelada al inicio de la sesión, puertas de aprobación escalonada, extracción bajo demanda de la sesión actual, fusión de casi duplicados, un ciclo de vida de archivo y reemplazo, metabolismo de memoria (dream), anclajes de memoria, recuperación semántica sobre incrustaciones locales, y el comando /memory.

Verificación de informes completos para informes científicos: comprobaciones por afirmación frente a Crossref, PubMed (escaneo de retractaciones), ClinicalTrials.gov, UniProtKB, GEO/SRA y PatentsView, accesibilidad de URL y coincidencia de títulos, significado afirmación-frente-a-fuente a temperatura 0, y un libro de auditoría durable y reiniciable con un informe anotado.

Plugin de bioinformática de «análisis por deseo»: cobertura completa de BioPython (ejecutor de código arbitrario bio_python + 14 skills de dominio) + herramientas semánticas de alta frecuencia + entorno Python autónomo sin dependencias (uv + venv + biopython descargado automáticamente al directorio privado del plugin). El usuario descarga e instala y puede hacer análisis por deseo.

蛋白质结构预测与设计插件：序列设计（ProteinMPNN/SolubleMPNN/LigandMPNN）、结构预测（ESMFold）、复合物界面筛选、序列理化打分与多样性聚类——零手动自举（本地 CPU/GPU 自适应），供 dsh-bio-genie 消费 | Protein structure prediction & design toolkit for dsh (sequence design, folding, interface screening)

基因组尺度代谢模型（GEM）构建插件：输入细菌全基因组（蛋白FASTA，支持多质粒/多染色体），自动构建+验证+补洞+出报告（SBML + 模型卡），供 dsh-bio-genie 消费工具加载使用 | Genome-scale metabolic model builder for dsh

Bioinformatics workflow catalog, WDL bundle store, and declarative preflight for DeepSeek Harness.